Vo vzťahu k poslaneckým návrhom zákonov majú dotknuté inštitúcie a verejnosť možnosť vyjadriť sa iba v rámci pripomienkového konania k návrhu stanoviska vlády k poslaneckému návrhu zákona, nie však k samotnému návrhu zákona. Toto pripomienkové konanie sa navyše uskutočňuje v skrátenej lehote a nevedie ho navrhovateľ zákona, ale vecne príslušné ministerstvo. Navrhuje sa, aby sa pripomienkové konanie uskutočnilo iba vo vzťahu k tým poslaneckým návrhom, o ktorých NR SR rozhodla, že ich prerokuje v druhom čítaní, a to v rámci druhého čítania ešte pred ich prerokovaním vo výboroch (bod 4). To znamená, že by poslanecké návrhy neboli pripomienkované ešte pred ich predložením do NR SR, ako je to v prípade vládnych návrhov. Vzhľadom na to, že v porovnaní s vládnymi návrhmi zákonov, oveľa väčšie množstvo poslaneckých návrhov zákonov nepostúpi do druhého čítania, neboli by pripomienkovému konaniu podrobované tie návrhy zákonov, ktoré nemajú šancu na prijatie.
V súvislosti s tým sa navrhuje predĺžiť lehotu na prerokovanie návrhu zákona, ktorý podal výbor alebo poslanci, v druhom čítaní z 30 na 60 dní (bod 3), pretože súčasná 30-dňová lehota na prerokovanie návrhu zákona v druhom čítaní vo výboroch nie je dostatočná na uskutočnenie pripomienkového konania. Predĺženie lehoty vytvorí väčší priestor aj pre vládu, aby mohla k poslaneckým návrhom zákonov zaujať stanovisko, keďže v súčasnosti sa stáva, že NR SR o návrhu zákona v druhom a treťom čítaní rozhodne ešte pred tým, ako k nemu vláda stihne zaujať stanovisko. Predĺženie lehoty na prerokovanie návrhu zákona v druhom čítaní umožní predĺžiť aj lehotu na pripomienkové konanie k návrhu stanoviska vlády. Zároveň to vytvorí priestor pre širšie oboznámenie sa dotknutých inštitúcií a verejnosti s návrhmi zákonov predkladaných poslancami a výbormi, ako aj na vyjadrenie názoru na ne.
Predpokladá sa, že druhé čítanie o návrhoch zákonov by sa vzhľadom na predĺženie lehoty na rokovanie výborov nekonalo na bezprostredne nasledujúcej riadnej schôdzi NR SR, ale až na tej ďalšej. A vo výboroch by návrhy boli prerokované až po skončení pripomienkového konania k návrhu stanoviska vlády, ako aj po schválení stanoviska vlády. Vo vzťahu k vládnym návrhom zákonov by predĺženie lehoty umožnilo ich dôkladnejšie prerokovanie poslancami a aj verejnosti dalo väčší priestor na vyjadrenie sa k vládnym návrhom zákonov počas ich prerokovania v NR SR.
Výbory, ktoré návrh prerokúvajú v druhom čítaní, by o pripomienkovom konaní informoval spravodajca (bod 5). Informácia o vyhodnotení pripomienkového konania k poslaneckému návrhu zákona bude súčasťou spoločnej správy (bod 6).
Pripomienkové konanie k návrhom zákonov, ktoré do NR SR predkladá vláda, je upravené v zákone o tvorbe právnych predpisov a o Zbierke zákonov. Poslaneckých návrhov zákonov sa však táto úprava netýka. S tým súvisí navrhovaná zmena tohto zákona v čl. II návrhu zákona. Úprava pripomienkového konania je v rámci zákona o tvorbe právnych predpisov a o Zbierke zákonov len rámcová, podrobnejšiu úpravu zákon prenecháva na Legislatívne pravidlá vlády, schválené uznesením vlády. Analogicky sa navrhuje, aby podrobnejšia úprava pripomienkového konania k poslaneckým návrhom zákonov bola zákonom o rokovacom poriadku ponechaná na Legislatívne pravidlá tvorby zákonov, ktoré uznesením schvaľuje NR SR (bod 2).