Implementácia vybraných  
investičných projektov  
z Plánu obnovy a odolnosti SR  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Kontrolná akcia bola vykonaná na Úrade podpredsedu vlády Slovenskej republiky pre Plán obnovy a znalostnú  
ekonomiku, na Ministerstve dopravy SR a v Železniciach Slovenskej republiky. Jej cieľom bolo preveriť  
implementáciu vybraných investičných projektov z Plánu obnovy a odolnosti SR na jednotlivých úrovniach riadenia.  
Plán obnovy mal celkovú alokáciu 6,4 mld. eur, z toho pre komponent udržateľnej dopravy bolo alokovaných  
808 mil. eur. NKÚ SR preveril osem projektov v celkovej hodnote 430 mil. eur, ktoré majú mať významný vplyv  
na efektívne využívanie ekologickej dopravy na Slovensku.  
Kontrola bola realizovaná v súlade so zákonom o NKÚ SR a so štandardmi vychádzajúcimi zo základných princípov  
kontroly podľa medzinárodných štandardov najvyšších kontrolných inštitúcií (ISSAI). Výber kontrolovaných  
subjektov bol uskutočnený s cieľom preveriť štruktúru riadenia projektov železničnej infraštruktúry z Plánu obnovy  
a odolnosti SR na vertikálnej úrovni.  
Železničná doprava zohráva dôležitú úlohu pri zabezpečovaní rýchlej, vysokokapacitnej, efektívnej a ekologickej  
prepravy. Predstavuje kľúčový prvok dopravného prepojenia Slovenska. Plán obnovy a odolnosti SR je jedným  
z nástrojov financovania rozvoja železničnej infraštruktúry. Ide o dokument, prostredníctvom ktorého sa Slovensko  
uchádzalo o prostriedky z európskeho mechanizmu na podporu obnovy a odolnosti. Plán obnovy zahŕňa reformy  
a investície v piatich oblastiach: kvalitné vzdelávanie, konkurencieschopné a inovatívne Slovensko, zelené  
Slovensko, zdravý život pre každého a efektívny štát s dôrazom na digitalizáciu. V rámci prípravy kontroly sme si  
stanovili priority a zamerali sme sa na oblasť zelenej ekonomiky, ktorej súčasťou bola aj železničná infraštruktúra.  
Zistenia identifikované na jednotlivých úrovniach riadenia projektov železničnej infraštruktúry financovaných  
z Plánu obnovy a odolnosti SR poukázali na nepripravenosť projektov, časové omeškania jednotlivých fáz a nízke  
čerpanie finančných prostriedkov určených na investície v oblasti železničnej infraštruktúry. Počas výkonu kontroly  
neboli NKÚ SR predložené kritériá výberu projektov zaradených do Plánu obnovy. Zistený bol nesúlad medzi  
metodickými pokynmi a aplikačnou praxou, ako aj nedostatočné nastavenie kontrolných mechanizmov. Dôležitým  
zistením bolo nedodržanie harmonogramu implementácie informačného systému Plánu obnovy, ktorého účelom  
bolo zabezpečiť transparentné a efektívne riadenie, finančné riadenie, monitorovanie, kontrolu poskytovania  
prostriedkov mechanizmu a poskytovanie informácií v súlade s legislatívou.  
Aj na základe záverov kontroly NKÚ SR bolo schválené uznesenie vlády SR č. 613/2025 z 10. 12. 2025, ktorým  
bol podporený návrh na vytvorenie Investičného plánu Slovensko. Uznesenie uložilo vypracovať v spolupráci  
s Úradom vlády SR, Ministerstvom financií SR a Ministerstvom pôdohospodárstva a rozvoja vidieka SR metodiku  
na posudzovanie návrhov prioritných investičných zámerov a návrh ich nadrezortnej priorizácie.  
2
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
VÝKON KONTROLNEJ AKCIE  
Účel kontrolnej akcie  
Preveriť proces implementácie a harmonogramu vybraných investičných projektov a opatrení realizovaných  
z Plánu obnovy a odolnosti SR a jeho súladu s príslušnou legislatívou.  
Rámec kontrolnej akcie  
Kontrola bola vykonaná ako kontrola súladu. Počas výkonu kontroly boli uplatnené viaceré kontrolórske metódy,  
najmä preskúmanie relevantných dokladov, analýzy, porovnávania písomných vyjadrení a vysvetlení  
kontrolovaných subjektov, ako aj rozhovory so zamestnancami. Kontrolovaným obdobím boli roky 2021 až 2025  
vrátane súvisiacich období. Preverované boli relevantné dokumenty, doklady a postupy potrebné na splnenie účelu  
a predmetu kontroly. Súčasťou kontroly bolo aj preverenie procesu výberu a implementácie projektov z Plánu  
obnovy a odolnosti SR a jeho súladu so systémom implementácie Plánu obnovy a odolnosti SR, zákonom  
o mechanizme na podporu obnovy a odolnosti a metodiky týkajúcej sa Plánu obnovy.  
Výber vzorky ôsmich projektov bol vykonaný z celkového zoznamu zverejnených projektov Plánu obnovy  
a odolnosti SR. Pri výbere bola použitá neštatistická metóda založená na stanovených kritériách a odbornom  
úsudku kontrolóra. Kritériá výberu boli: časový harmonogram ukončenia projektu do termínu 06/2026, finančná  
významnosť investičných projektov nad 20 mil. eur, charakter projektu ako infraštruktúrneho.  
Výsledky kontrolnej akcie  
Úrad podpredsedu vlády Slovenskej republiky pre Plán obnovy  
a znalostnú ekonomiku - Národná implementačná a koordinačná  
autorita  
Koordinácia a monitoring vykonávateľov  
Národná implementačná a koordinačná autorita bola zriadená na základe uznesenia vlády č. 221 z 28. apríla 2021  
k návrhu Plánu obnovy a odolnosti Slovenskej republiky. Od svojho vzniku bola inštitucionálne zaradená pod Úrad  
vlády Slovenskej republiky. V súlade so zákonom č. 575/2001 Z. z. bol s účinnosťou od 27. júna 2024 zriadený  
Úrad podpredsedu vlády pre Plán obnovy a znalostnú ekonomiku, do ktorého bola NIKA organizačne začlenená.  
NIKA plní úlohu jednotného kontaktného miesta pre komunikáciu s Európskou komisiou v súvislosti s Plánom  
obnovy. Zabezpečuje metodické usmerňovanie subjektov zapojených do Plánu obnovy, vykonáva kontrolu  
vykonávateľov, sprostredkovateľov a prijímateľov, vypracúva systém implementácie Plánu obnovy a monitoruje  
stav jeho realizácie. Ďalšie úlohy NIKA vyplývajú zo zákona č. 368/2021 Z. z. o mechanizme na podporu obnovy  
a odolnosti.  
Identifikované nedostatky v NIKA sa týkali nesúladu medzi metodickými pokynmi a aplikačnou praxou v súvislosti  
s tým, že NIKA nezverejňovala aktuálne informácie súvisiace s vybranými projektmi z Plánu obnovy a odolnosti SR  
na webovom portáli. Ďalej bolo zistené nedostatočné nastavenie kontrolných mechanizmov a nedodržanie  
harmonogramu implementácie informačného systému Plánu obnovy.  
Ministerstvo dopravy Slovenskej republiky plní úlohu vykonávateľa investície financovanej z Plánu obnovy.  
V súlade so schválenou metodikou predkladalo NIKA pravidelné monitorovacie správy, ktorých cieľom bolo  
preukazovať priebeh implementácie investície. Monitorovacie správy boli predkladané v mesačnej periodicite  
a obsahovali informácie o stave fyzickej a finančnej realizácie investícií, ako aj údaje o plnení harmonogramu  
monitorovacích krokov. Kontrola zistila, že predkladané monitorovacie správy neobsahovali rozsah a závažnosť  
vzniknutých omeškaní v procese implementácie. V dôsledku pretrvávajúcich meškaní bolo potrebné opakovane  
upravovať harmonogramy realizácie. Na základe zistených nedostatkov a výrazného časového sklzu (porovnanie  
s pôvodným harmonogramom realizácie projektu – meškanie 14 mesiacov) bol počas výkonu kontroly projekt  
3
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Rekonštrukcia trate Veľký Horeš – Streda nad Bodrogom vyradený z Plánu obnovy. Na tento projekt bola pôvodne  
alokovaná suma 40,6 mil. eur.  
NKÚ SR zistil nedostatky v plnení povinností zo strany NIKA pri monitorovaní implementácie projektu  
Rekonštrukcia železničnej trate Veľký Horeš Streda nad Bodrogom. NIKA nedodržala ustanovenia Systému  
implementácie Plánu obnovy a odolnosti, týkajúce sa monitorovania, včasnej identifikácie potenciálnych problémov  
a rizík a prijatie primeraných nápravných opatrení.  
Tabuľka č. 1 Prehľad vybraných investičných projektov z Plánu obnovy *  
Celkové oprávnené výdavky bez  
Názov projektu  
DPH (zazmluvnené)  
Bánovce nad Ondavou - Humenné, elektrifikácia a komplexná  
rekonštrukcia trate  
221 458 874,81 €  
43 060 224,37 €  
Zväčšenie priepustnosti trate Bratislava Rača – Leopoldov  
ŽST Levice, obnova výhybiek a nové diaľkovo ovládané staničné  
a traťové zabezpečovacie zariadenia na úseku Kalná nad Hronom (mimo)  
Kozárovce (mimo)“  
41 266 467,37 €  
38 571 843,87 €  
Hronský Beňadik - Nová Baňa (mimo), komplexná rekonštrukcia  
železničnej trate  
Bratislava Nové Mesto – Bratislava ÚNS, komplexná rekonštrukcia trate  
Nižná Myšľa Ruskov, komplexná rekonštrukcia koľaje č. 2  
Fiľakovo Holiša, rekonštrukcia železničnej trate  
31 705 613,82 €  
28 354 754,14 €  
24 945 949,25 €  
429 363 727,63 €  
SPOLU  
Zdroj: ŽSR, spracovanie NKÚ SR  
* Vyradený projekt Veľký Horeš Streda nad Bodrogom  
Informačný a monitorovací systém Plánu obnovy - ISPO  
Projekt ISPO bol schválený Ministerstvom investícií, regionálneho rozvoja a informatizácie SR dňa 20. mája 2022  
v celkovej hodnote 4,26 mil. eur vrátane DPH a bol financovaný z Plánu obnovy. Jeho cieľom bolo vytvoriť  
informačný systém zabezpečujúci podporu procesov implementácie, administrácie a monitorovania Plánu obnovy  
na národnej úrovni v súlade s požiadavkami Európskej komisie, najmä podľa článku 22 nariadenia (EÚ)  
2021/241 a § 11 zákona č. 368/2021 Z. z. o mechanizme na podporu obnovy a odolnosti.  
Informačný systém bol uvedený do prevádzky v júli 2022, pričom prvé výzvy boli vyhlásené v marci 2023. Fáza 1.0  
bola zameraná na zabezpečenie základných funkčných požiadaviek stanovených Európskou komisiou. Od apríla  
2024 projekt pokračoval realizáciou fázy 2.0, orientovanej na vývoj pod verejnou licenciou Európskej únie. Plná  
produkčná verzia systému bola nasadená 8. októbra 2025, s časovým oneskorením 24 mesiacov oproti pôvodne  
plánovanému termínu.  
NKÚ SR zistil, že informačný systém ISPO nebol v období realizácie preverovaných projektov v produkčnom  
prostredí vybavený na komplexné riadenie a kontrolu implementácie Plánu obnovy. V dôsledku toho prijímateľ  
podával žiadosti o platbu prostriedkov mechanizmu mimo prostredia ISPO. Do systému boli následne  
zaznamenávané iba súhrnné údaje, a to výlučne na účely zabezpečenia poskytovania požadovaných dát Európskej  
komisii.  
Kontrola ďalej poukázala, že absentovali niektoré funkcionality v ISPO, ktoré mali byť funkčné, tak ako je uvedené  
v zákone o mechanizme, podľa ktorého mal informačný systém ISPO zabezpečovať transparentné a efektívne  
riadenie, finančné riadenie a kontrolu poskytovania prostriedkov na národnej úrovni. V preverovanom období ISPO  
neumožňoval realizovať kľúčové procesy, ako je overovanie oprávnenosti výdavkov, využívanie kontrolných  
4
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
zoznamov k žiadostiam o platbu ani správu súvisiacej dokumentácie, ktorá mala byť podľa projektového zámeru  
integrálnou súčasťou systému.  
Do nasadenia verzie ISPO 2.0 (produkčné nasadenie 8. októbra 2025) plnil informačný systém prevažne evidenčnú  
funkciu. Hoci žiadosti o poskytnutie prostriedkov mechanizmu boli do systému ISPO doručované, ich vecné,  
odborné a finančné posudzovanie prebiehalo mimo systému, prostredníctvom interných procesov vykonávateľa.  
Po ukončení hodnotenia boli do ISPO spätne zaznamenávané iba základné údaje o výsledku, najmä informácia  
o stave žiadosti, číslo žiadosti o platbu, identifikácia prijímateľa, údaje o dodávateľoch a subdodávateľoch, štruktúra  
výdavkov a dátumy predloženia žiadosti a vyplatenia prostriedkov.  
V preverovanom období informačný systém ISPO neplnil funkciu nástroja na riadenie a kontrolu implementácie  
projektov Plánu obnovy a odolnosti, ako to vyžaduje zákon o mechanizme. Systém slúžil predovšetkým  
na evidenčné a vykazovacie účely, najmä na zabezpečenie poskytovania údajov Európskej komisii.  
Nasadením verzie ISPO 2.0 bola funkcionalita systému rozšírená o procesné a kontrolné prvky. Do systému boli  
implementované používateľské role pre posudzovateľov, hodnotiteľov a arbitrov, ktoré umožňujú vedenie,  
dokumentovanie a auditovateľné vyhodnocovanie celého procesu priamo v systéme. Po tejto aktualizácii ISPO  
zabezpečuje prepojené spracovanie žiadostí, evidenciu hodnotiacich posudkov a kontrolných úkonov, ako aj  
elektronické podávanie a spracovanie žiadostí o platbu.  
Keďže funkčné rozšírenie systému ISPO bolo nasadené až v októbri 2025, viaceré projekty Plánu obnovy, vrátane  
preverovaných železničných investičných projektov vybranej vzorky, boli implementované ešte pred týmto  
termínom. V období ich realizácie ISPO neobsahoval v plnom rozsahu funkcionality potrebné na riadenie, finančné  
riadenie a kontrolu poskytovania prostriedkov prostredníctvom systému. Tento stav bol v čiastočnom rozpore  
so základnou požiadavkou zákona o mechanizme na podporu obnovy a odolnosti.  
Kontrola zistila, že NIKA nedodržala plánovaný harmonogram realizácie projektu ISPO. V dôsledku časového  
omeškania systém v preverovanom období neobsahoval procesné funkcionality pokrývajúce celý životný cyklus  
grantovej schémy, ktoré sú nevyhnutné pre transparentné a efektívne riadenie, finančné riadenie, monitorovanie  
a kontrolu poskytovania prostriedkov mechanizmu. Tým došlo v určitej časti k nesúladu s požiadavkami zákona  
o mechanizme na podporu obnovy a odolnosti. Zber údajov bol zároveň zabezpečený v súlade s príslušným  
nariadením EÚ.  
Ministerstvo dopravy SR  
Príprava a realizácia projektov  
V zmysle zákona o mechanizme na podporu obnovy a odolnosti je vykonávateľom ústredný orgán štátnej správy  
určený vládou, ktorý zodpovedá za realizáciu investície alebo reformy v súlade s Plánom obnovy, vrátane plnenia  
a dosahovania míľnikov a cieľov v súlade s dohodou podľa osobitného predpisu. Na základe uznesenia vlády SR  
č. 221 z 28. apríla 2021 k návrhu Plánu obnovy a odolnosti SR a uznesenia vlády SR č. 560 z 29. septembra 2021  
k návrhu na uzatvorenie Dohody o financovaní medzi Európskou komisiou a Slovenskou republikou bolo  
Ministerstvo dopravy SR určené ako vykonávateľ zodpovedný za realizáciu predmetnej investície.  
Kontrola identifikovala nedostatky na MD SR najmä v procese výberu projektov zaradených do Plánu obnovy  
a v oneskorenej implementácii vybraných investičných projektov v nadväznosti na harmonogram. Kontrolovaný  
subjekt nevedel preukázať spôsob výberu projektov realizovaných z Plánu obnovy.  
Metodika prípravy a hodnotenia investičných projektov bola vypracovaná Útvarom hodnoty za peniaze vo februári  
2022 a schválená uznesením vlády SR č. 181/2022 zo dňa 16. marca 2022. Metodika stanovovala jednoznačné  
a systematické pravidlá procesu riadenia verejných investícií, od počiatočnej identifikácie a určenia investičných  
priorít, cez prípravu investičných projektov a posúdenie ich spoločensko-ekonomickej návratnosti, až po ich  
realizáciu a následné vyhodnotenie. Metodika zároveň definovala spoluprácu medzi jednotlivými zúčastnenými  
stranami a princípy transparentnej výmeny údajov. Bola záväzná pre všetky kapitoly štátneho rozpočtu, rozpočtové  
a príspevkové organizácie kapitol a ostatné subjekty verejnej správy v ich riadiacej pôsobnosti, ktoré pripravujú  
investičné projekty alebo koncesie s použitím verejných prostriedkov.  
5
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
MD SR pri výbere projektov ŽSR zohľadňovalo nasledovné minimálne požiadavky:  
súlad s legislatívou EÚ a SR,  
súlad s podmienkami oprávnenosti (Green a Digital) a napĺňaním MU pre POO SR Komponent 3,  
súlad s prioritami a harmonogramom,  
súlad s obdobím oprávnenosti POO SR (projekty vybrané na realizáciu z POO SR s termínom ukončenia  
najneskôr do 30. 06. 2026).  
Z vykonanej kontroly vyplynulo, že v predloženej dokumentácii chýbali kritériá pre jednoznačný a preukázateľný  
spôsob schválenia vybraných projektov zaradených do Plánu obnovy.  
Z vybranej vzorky ôsmich projektov bol v čase výkonu kontroly vyradený projekt Veľký Horeš – Streda nad  
Bodrogom, rekonštrukcia železničnej trate. MD SR evidovalo prvotnú informáciu o rizikovosti projektu v januári  
2025, keď ŽSR informovali o podaných námietkach neúspešného uchádzača v rámci procesu verejného  
obstarávania. O definitívnom vyradení projektu z Plánu obnovy a odolnosti SR bolo rozhodnuté v júli 2025. MD SR  
sa počas roka 2025 opakovane dopytovalo ŽSR na riziká spojené s verejným obstarávaním, pričom bolo  
ubezpečované, že projekt bude ukončený do júna 2026. V auguste 2025 bolo na stretnutí so ŽSR rozhodnuté, že  
projekt nebude financovaný z Plánu obnovy a ŽSR predložia náhradné projekty. Ku dňu ukončenia kontroly nevedel  
kontrolovaný subjekt preukázať, ktorými projektmi bude vyradený projekt nahradený.  
Pri preverení implementačných plánov projektu Veľký Horeš Streda nad Bodrogom NKÚ SR zistil meškania  
v ukončení majetkovoprávneho vysporiadania pozemkov a v nadväznosti na to aj posuny pri získaní právoplatného  
stavebného povolenia. Súčasne sa posúval aj termín podpisu zmluvy o dielo. Uvedené meškanie spôsobilo  
nemožnosť zabezpečiť realizáciu projektu do 30. 06. 2026, keďže dĺžka výstavby bola odhadovaná na približne  
11 mesiacov. Podľa NKÚ SR z dôvodu nedostatočnej pripravenosti projektu vznikol obmedzený časový priestor  
na realizáciu náhradných projektov.  
Kontrolná skupina NKÚ SR poukázala na oneskorenú implementáciu preverovaných projektov v nadväznosti  
na harmonogramy plánovanej realizácie projektov, keďže pri piatich z nich (ŽST Levice, Nižná Myšľa – Ruskov,  
Bratislava Rača – Leopoldov, Bratislava Nové Mesto Bratislava ÚNS, Fiľakovo - Holiša) začala výstavba až v roku  
2025 (viď. obrázok č.1), teda v predposlednom roku pred ukončením obdobia oprávnenosti výdavkov, a zároveň  
ich nepripravenosť zo strany MD SR.  
Železnice Slovenskej republiky  
Príprava a realizácia projektov  
Železnice Slovenskej republiky na území Slovenskej republiky spravujú železničnú infraštruktúru vo vlastníctve  
štátu a zabezpečujú prepravné a dopravné služby v súlade so štátnou dopravnou politikou a požiadavkami trhu,  
vrátane súvisiacich činností.  
Podľa § 34 zákona č. 513/2009 Z. z. o dráhach a na základe platnej Zmluvy o prevádzke železničnej infraštruktúry  
vykonávajú funkciu manažéra infraštruktúry, z ktorej im vyplýva povinnosť organizovať a zabezpečovať  
prevádzkyschopnosť celoštátnych a regionálnych tratí a organizovať vlakovú dopravu pre všetkých dopravcov  
na nediskriminačnom princípe. Železnice Slovenskej republiky k 31. 12. 2024 spravovali 3 629 km tratí, z toho  
1 582 km elektrifikovaných.  
Podľa dokumentu Plánu obnovy MD SR na základe zásobníka projektov vedeného ŽSR a investičného plánu  
vybralo konkrétne projekty obnovy železničnej infraštruktúry na realizáciu z prostriedkov mechanizmu a následne  
MD SR uzatváralo zmluvné vzťahy s prijímateľom, ktorý investície realizoval. Prijímateľom investícií do železničnej  
infraštruktúry bol podľa Plánu obnovy individuálne určený manažér infraštruktúry ŽSR.  
Kontrolou bolo identifikované nízke čerpanie finančných prostriedkov preverovaných projektov z Plánu obnovy,  
vo vzťahu k blížiacemu sa termínu plánovaného ukončovania projektov a oprávnenosti výdavkov. Čerpanie  
k 13. 11. 2025 predstavovalo sumu len 235 mil. eur, čo zodpovedalo 55 % z celkových oprávnených výdavkov.  
Pri projekte Zväčšenie priepustnosti trate Bratislava Rača – Leopoldov, ktorý mal druhú najvyššiu alokáciu  
6
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
oprávnených výdavkov podľa zmluvy o poskytnutí prostriedkov mechanizmu (viac ako 43 mil. eur), bolo zistené  
nulové čerpanie. Ku dňu ukončenia kontroly nebola pre tento projekt predložená žiadna žiadosť o platbu.  
Graf č. 1 Prehľad čerpania finančných prostriedkov kontrolovaných projektov z Plánu obnovy (stav k 13. 11. 2025)  
Zdroj: ŽSR, spracovanie NKÚ SR  
Prijímateľ začal predkladať ŽoP v druhej polovici roku 2024 pre projekt Bánovce nad Ondavou Humenné,  
elektrifikácia a komplexná rekonštrukcia trate. Pre zvyšné projekty ŽSR začal predkladať ŽoP v marci 2025.  
Podľa uvedených skutočností prijímateľ na vyčerpanie zostatku celkových oprávnených výdavkov len  
16 mesiacov t. j. do 31. 07. 2026, kedy je najneskôr povinný predložiť záverečnú ŽoP v súlade so zmluvou  
o poskytnutí prostriedkov mechanizmu. Zostatok na dočerpanie k 13. 11. 2025 bol vo výške viac ako 193 mil. eur  
oprávnených výdavkov.  
7
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Tabuľka č. 2 Prehľad implementácie kontrolovaných projektov z Plánu obnovy (stav k 13. 11. 2025)  
Názov a číslo projektu Celkové  
Stav čerpania  
Suma  
Zostatok sumy  
v eur bez DPH vyjadrené  
na dočerpanie v %  
COV  
oprávnené  
výdavky v eur  
bez DPH (podľa  
(suma uhradených predložených /  
ŽoP v eur bez DPH) neuhradených  
ŽoP v eur bez  
ZoPPM )  
DPH*  
Bánovce nad Ondavou  
- Humenné,  
elektrifikácia a  
komplexná  
rekonštrukcia trate  
Zväčšenie priepustnosti  
trate Bratislava Rača –  
Leopoldov  
221 458 874,81  
43 060 224,37  
169 364 606,13  
0,00  
13 091 449,55 52 094 268,68 76,48%  
0,00 43 060 224,37  
0,00%  
ŽST Levice, obnova  
výhybiek a nové  
diaľkovo ovládané  
staničné a traťové  
zabezpečovacie  
zariadenia na úseku  
Kalná nad Hronom  
(mimo) – Kozárovce  
(mimo)  
41 266 467,37  
18 166 137,74  
2 918 623,77 23 100 329,63 44,02%  
Hronský Beňadik -  
Nová Baňa (mimo),  
komplexná  
rekonštrukcia  
železničnej trate  
38 571 843,87  
31 705 613,82  
28 354 754,14  
23 579 678,61  
16 163 963,70  
6 344 652,49  
0,00 14 992 165,26 61,13%  
2 592 463,89 15 541 650,12 50,98%  
623 369,42 22 010 101,65 22,38%  
Bratislava Nové Mesto  
– Bratislava ÚNS,  
komplexná  
rekonštrukcia trate  
Nižná Myšľa – Ruskov,  
komplexná  
rekonštrukcia koľaje č.  
2
Fiľakovo Holiša,  
rekonštrukcia  
železničnej trate  
24 945 949,25  
429 363 727,63  
1 780 031,90  
10 269 017,38 23 165 917,35  
7,14%  
SPOLU  
Zdroj: ŽSR, spracovanie NKÚ SR  
235 399 070,57  
29 494 924,01 193 964 657,06 54,83%  
*odoslané ŽoP, ktoré ešte v čase výkonu kontroly NKÚ SR neboli uhradené na účet prijímateľa, ale boli vykonávateľom  
schválené v rámci AFK.  
Preverované projekty boli implementované s časovým oneskorením, keďže pri piatich z nich začala výstavba  
až v roku 2025, teda v predposlednom roku pred ukončením obdobia oprávnenosti výdavkov. Prijímateľ predkladal  
žiadosti o platbu na základe dohody medzi MD SR a ŽSR fyzickým sprievodným listom spolu s elektronickým  
nosičom CD/DVD do podateľne MD SR a zároveň v elektronickej forme prostredníctvom systému Fabasoft cez  
eDesk ÚPVS. Tento postup bol uplatňovaný z dôvodu, že systém ISPO ani po viac ako troch rokoch od jeho  
uvedenia do prevádzky (júl 2022) neumožňoval predkladanie ŽoP zo strany prijímateľa. Predpokladané termíny  
začatia a ukončenia výstavby jednotlivých projektov sa v harmonogramoch a implementačných plánoch z rokov  
2022 2025 opakovane posúvali. Hlavnými dôvodmi boli omeškania pri ukončení majetkovoprávneho  
8
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
vysporiadania pozemkov (v priemere o viac ako 10 mesiacov oproti plánu) a omeškania pri vydávaní stavebných  
povolení (v priemere až o 22 mesiacov). Tieto skutočnosti mali priamy vplyv na oneskorené vyhlasovanie verejných  
obstarávaní, podpis zmlúv o dielo a samotné začatie a ukončenie výstavby, ktoré bolo priemerne v omeškaní  
o viac ako sedem mesiacov oproti plánovaným termínom.  
Obrázok č.1: Prehľad prípravy a realizácie kontrolovaných projektov vrátane omeškania jednotlivých procesov (v mesiacoch)  
Projekt Bánovce nad Ondavou - Humenné, elektrifikácia a komplexná rekonštrukcia trate  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Ukončenie VO  
03/2023  
05/2023  
2
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
Predpokladaný termín splnenia  
Skutočný termín splnenia  
12/2022  
08/2024  
20  
02/2023  
02/2025  
24  
07/2022  
08/2022  
1
03/2023  
05/2023  
2
06/2025  
12/2025*  
6
Omeškanie v mesiacoch  
Projekt Hronský Beňadik - Nová Baňa (mimo), komplexná rekonštrukcia železničnej trate  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Ukončenie VO  
08/2023  
05/2024  
9
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
Predpokladaný termín splnenia  
Skutočný termín splnenia  
12/2022  
06/2023  
6
08/2023  
08/2024  
12  
11/2022  
08/2023  
9
09/2023  
07/2024  
10  
10/2024  
09/2025  
11  
Omeškanie v mesiacoch  
Projekt ŽST Levice, obnova výhybiek a nové diaľkovo ovládané staničné a traťové zabezpečovacie  
zariadenia na úseku Kalná nad Hronom (mimo) - Kozárovce (mimo)  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Ukončenie VO  
11/2023  
12/2024  
13  
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
Predpokladaný termín splnenia  
Skutočný termín splnenia  
09/2019  
12/2020  
15  
03/2017  
07/2021  
52  
01/2023  
03/2024  
14  
03/2024  
01/2025  
10  
11/2024  
01/2026*  
14  
Omeškanie v mesiacoch  
Projekt Nižná Myšľa - Ruskov, komplexná rekonštrukcie koľaje č. 2  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Ukončenie VO  
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
Predpokladaný termín splnenia  
Skutočný termín splnenia  
08/2022  
10/2023  
14  
02/2023  
12/2024  
22  
08/2023  
03/2024  
7
03/2024  
12/2024  
9
05/2024  
02/2025  
9
12/2025  
06/2026*  
-1  
Omeškanie v mesiacoch  
Projekt Zväčšenie priepustnosti trate Bratislava Rača - Leopoldov  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Ukončenie VO  
12/2024  
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
Predpokladaný termín splnenia  
-
06/2025  
09/2025  
2***  
03/2024  
03/2024  
0
12/2024  
03/2025  
3
03/2026  
05/2026*  
2
Skutočný termín splnenia  
-
02/2025  
-**  
2
Omeškanie v mesiacoch  
9
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Projekt Bratislava Nové Mesto Bratislava ÚNS, komplexná rekonštrukcia trate  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Ukončenie VO  
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
Predpokladaný termín splnenia  
Skutočný termín splnenia  
12/2022  
08/2022  
-4  
04/2023  
11/2024  
19  
10/2023  
03/2024  
5
05/2024  
05/2024  
02/2025  
9
03/2025  
12/2025*  
9
12/2024  
7
Omeškanie v mesiacoch  
Projekt Fiľakovo - Holiša, rekonštrukcia železničnej trate  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Predpokladaný termín splnenia  
Ukončenie VO  
03/2024  
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
12/2022  
12/2023  
12  
12/2022  
12/2024  
24  
06/2023  
03/2024  
9
05/2024  
02/2025  
9
11/2024  
12/2025*  
13  
Skutočný termín splnenia  
12/2024  
9
Omeškanie v mesiacoch  
Projekt Rekonštrukcia trate Veľký Horeš - Streda nad Bodrogom  
MPV pozemkov Stavebné povolenia Vyhlásenie VO  
Predpokladaný termín splnenia  
Ukončenie VO  
Začatie výstavby Ukončenie výstavby  
04/2023  
06/2025  
26  
06/2023  
06/2023  
03/2024  
9
03/2024  
05/2024  
05/2025  
08/2025****  
-
Skutočný termín splnenia  
-*  
-*  
-*  
-
-
-
Omeškanie v mesiacoch  
oneskorenie  
splnené, resp. splnené s oneskorením (do 3 mesiacov)  
* počas výkonu kontroly nebola výstavba ukončená (resp. uvedený proces nebol ukončený)  
** nebolo potrebné MPV pozemkov  
*** MD SR vydalo 24.10.2025 overovaciu doložku projektu stavby na ohlásenie pre objekt SO 02 doplnenie optického kábla v úseku trate  
ŽST Trnava ŽST Nové Mesto nad Váhom, 10.09.2025 zaslalo MD SR odpoveď, že na ostatné objekty nebola nutná ohláška ani  
stavebné povolenie  
**** 21.08.2025 bolo vydané Rozhodnutie o vyradení projektu z financovania POO SR  
Zdroj: ŽSR, spracovanie NKÚ SR  
Neskorá implementácia mala priamy vplyv na stav čerpania finančných prostriedkov, v dôsledku čoho zostáva  
v období siedmich mesiacov do ukončenia oprávnenosti výdavkov vyčerpať viac ako 193 mil. eur. Táto suma  
predstavuje významné riziko nedočerpania finančných prostriedkov vzhľadom na blížiaci sa termín ukončenia  
obdobia oprávnenosti výdavkov do 30. 06. 2026. Z pohľadu NKÚ SR je indikované riziko, že SR nedokáže využiť  
zazmluvnené finančné prostriedky do konca obdobia oprávnenosti výdavkov.  
V čase výkonu kontroly NKÚ SR bola ukončená výstavba len jedného projektu Hronský Beňadik Nová Baňa,  
komplexná rekonštrukcia železničnej trate, a to s časovým oneskorením jedenásť mesiacov oproti termínu  
uvedenému v harmonograme z roku 2022. Pri dvoch kontrolovaných projektoch boli termíny ukončenia výstavby  
stanovené na máj a jún 2026, teda na takmer posledný možný termín ukončenia obdobia oprávnenosti výdavkov  
podľa zákona o mechanizme, ktorý končí 30. 06. 2026. Tento stav predstavuje zvýšené riziko nedočerpania  
finančných prostriedkov, a to aj vzhľadom na povinnosť predložiť záverečnú žiadosť o platbu najneskôr  
do 31. 07. 2026.  
10  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Záver  
NKÚ SR poukazuje na skutočnosť, že implementácia vybraných investičných projektov v oblasti železničnej  
dopravy na Slovensku prebiehala s výraznými časovými omeškaniami, ktoré mali priamy vplyv na plnenie míľnikov,  
cieľov a čerpanie finančných prostriedkov z Plánu obnovy. Kľúčové procesy prípravy projektov, najmä  
majetkovoprávne vysporiadanie pozemkov, vydávanie stavebných povolení a realizácia verejných obstarávaní, boli  
opakovane posúvané, čo spôsobilo neskoré začatie výstavby pri väčšine kontrolovaných projektov. Tieto  
omeškania následne ovplyvnili aj harmonogramy realizácie stavebných prác a schopnosť prijímateľa predkladať  
žiadosti o platbu v súlade s termínmi oprávnenosti výdavkov.  
Ku dňu ukončenia kontroly zostávalo vyčerpať viac ako 193 mil. eur z celkového objemu 429 mil. eur  
v obmedzenom časovom období pred ukončením oprávnenosti výdavkov. Uvedené poukazuje na zvýšené riziko  
nedočerpania alokovaných prostriedkov a ohrozenia dosiahnutia cieľov v oblasti modernizácie železničnej  
infraštruktúry, najmä v kontexte pevne stanovených termínov pre predkladanie záverečných žiadostí o platbu. Plán  
obnovy je súčasťou nástroja Next Generation EU, zameraného na zmiernenie hospodárskych a sociálnych  
dopadov pandémie COVID-19. Slovenská republika získala finančné prostriedky formou nenávratných finančných  
príspevkov (grantov) určených na konkrétne účely.  
Vláda SR svojím uznesením č. 613/2025 zo dňa 10. 12. 2025 schválila „Návrh na vytvorenie Investičného plánu  
Slovensko“. Z vlastného materiálu k predmetnému uzneseniu vyplynulo, že návrh nadväzuje a reaguje aj  
na opakované zistenia a odporúčania NKÚ SR, ktoré poukazujú na „chaos a roztrieštenosť pri strategickom  
investičnom plánovaní“ a odporúčajú vypracovať zoznam najväčších investičných projektov, ktoré sa majú  
v nasledujúcom období financovať na základe kvalitne pripravených strategických materiálov s jasne definovanými  
cieľmi a merateľnými ukazovateľmi, ktoré umožnia efektívne monitorovanie ich plnenia. Kontrolné závery neostali  
len na úrovni identifikácie nedostatkov, ale boli priamo zohľadnené pri tvorbe systémového a koncepčného  
materiálu, čím došlo k ich implementácii do rozhodovacích a riadiacich procesoch verejnej správy.  
Kontrola poukázala na potrebu posilnenia projektového riadenia, zlepšenia plánovania a reálneho nastavenia  
harmonogramov, ako aj na potrebu včasnej identifikácie rizík a prijímania adekvátnych opatrení zo strany  
vykonávateľa a prijímateľa. Zistené nedostatky zároveň odhalili systémové problémy v železničnej doprave, ktoré  
ovplyvňujú schopnosť Slovenskej republiky efektívne využívať dostupné finančné zdroje EÚ. Efektívne a účinné  
riadenie železničnej dopravy na Slovensku je dlhodobý problém, ktorý negatívne ovplyvňujú nedostatočné  
personálne kapacity, zastaraná infraštruktúra, nedostatok ucelenej vízie a jasne stanovené priority v danej oblasti.  
NKÚ SR pozitívne hodnotí vytvorenie informačného systému vo vlastníctve štátu a jeho možné následné  
využívanie orgánmi štátnej správy a inštitúciami zapojenými do čerpania a implementácie európskych fondov.  
Systém predstavuje významný prvok pri zabezpečovaní jednotného, centralizovaného a transparentného  
spracovania údajov v rámci implementácie verejných politík a finančných mechanizmov.  
Realizáciou vybraných investičných projektov železničnej infraštruktúry financovaných z Plánu obnovy sa má zvýšiť  
dostupnosť a úroveň modernizácie ekologickej dopravy. Plán obnovy predstavuje pre Slovenskú republiku  
významnú príležitosť získať rozsiahle finančné prostriedky z na zlepšenie kvality života obyvateľov, podporu  
zelenej transformácie a digitálneho rozvoja. Bol koncipovaný tak, aby prostredníctvom investícií do kľúčových  
oblastí stimuloval ekonomický rast a posilnil odolnosť krajiny.  
Reakcia kontrolovaného subjektu  
Z kontrolnej akcie boli vypracované tri protokoly o výsledku kontroly. Proti pravdivosti, úplnosti a preukázateľnosti  
kontrolných zistení podal námietky jeden kontrolovaný subjekt – MD SR. Námietky sa týkali jedného kontrolného  
zistenia, podľa ktorého harmonogram prípravy a výstavby projektov železničnej infraštruktúry za rok 2023 nebol v čase  
výkonu kontroly zverejnený na webovom sídle ministerstva, čo nebolo v súlade s uznesením vlády SR č. 101 zo 16.  
februára 2022. Na základe listinných dôkazov však bolo preukázané, že MD SR zverejnilo požadované dokumenty  
na pôvodnej webovej stránke, ktorá bola v čase plnenia úlohy aktuálnou. Uvedený nedostatok bol ministerstvom  
odstránený v priebehu výkonu kontroly.  
11  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Všetky kontrolované subjekty sa zaviazali prijať opatrenia na odstránenie zistených nedostatkov a následne predložiť  
správu o ich splnení alebo priebežnom plnení. NKÚ SR bude plnenie prijatých opatrení v rámci svojej činnosti  
monitorovať a vyhodnocovať ich adekvátnosť.  
Kontakt  
Najvyšší kontrolný úrad SR  
Priemyselná 2  
Úrad podpredsedu vlády SR pre Plán obnovy a znalostnú ekonomiku  
Tomášikova 14366/64A  
824 73 Bratislava  
831 04 Bratislava  
Ministerstvo dopravy SR  
Námestie slobody 6  
Železnice Slovenskej republiky  
Klemensova 8  
811 05 Bratislava  
813 61 Bratislava  
+421 2 20 292 000  
Zoznam použitých skratiek  
AFK  
COV  
Administratívna finančná kontrola  
Celkové oprávnené výdavky  
EÚ  
Európska únia  
ISPO  
Komponent 3  
MD SR  
MPV  
Informačný a monitorovací systém plánu obnovy  
Komponent udržateľná doprava  
Ministerstvo dopravy Slovenskej republiky  
Majetkovo právne vysporiadanie pozemkov  
Monitorovacia správa  
MS  
MU  
Merateľný ukazovateľ  
Nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ)  
2021/241 z 12. februára 2021, ktorým sa zriaďuje  
Mechanizmus na podporu obnovy a odolnosti  
Národná implementačná a koordinačná autorita  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Národná rada Slovenskej republiky  
Plán obnovy a odolnosti SR  
Nariadenie (EÚ)  
NIKA  
NKÚ SR  
NR SR  
POO SR, Plán obnovy  
SR  
Slovenská republika  
ÚPVS  
VO  
Ústredný portál verejnej správy  
Verejné obstarávanie  
Zákon č. 575/2001 Z. z. o organizácii činnosti vlády a  
organizácii ústrednej štátnej správy  
Zákon č. 368/2021 Z. z. o mechanizme na podporu  
Zákon o organizácii činnosti vlády  
Zákon o mechanizme na podporu obnovy a odolnosti  
obnovy a odolnosti  
Zmluva o poskytnutí prostriedkov mechanizmu na  
podporu obnovy a odolnosti  
Žiadosť o platbu  
ZoPPM  
ŽoP  
ŽSR  
Železnice Slovenskej republiky  
12  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Prílohy  
Príloha č. 1 Vybrané investičné projekty železničnej infraštruktúry z Plánu obnovy  
Zdroj: ŽSR, spracovanie NKÚ SR