Správa o výsledku kontroly  
2024  
Zrušenie štátneho podniku -  
Agroinštitút Nitra, štátny podnik  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Ministerstvo pôdohospodárstva a rozvoja vidieka SR; Inštitút znalostného pôdohospodárstva  
a inovácií; agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO, štátny podnik a Okresný úrad v Nitre  
Agroinštitút Nitra, štátny podnik, bol rozhodnutím MPRV SR, ako jeho zakladateľa, zrušený zlúčením so štátnym  
podnikom agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO k 1.1.2023. Štátny podnik bol rezortným vzdelávacím  
zariadením MPRV SR a bol založený na plnenie úloh vo verejnom záujme v oblasti celoživotného vzdelávania  
a pôdohospodárskeho poradenstva. Za posledných päť rokov dosiahol kladný výsledok hospodárenia iba v roku  
2019.  
Kontroly boli realizované v súlade so zákonom o NKÚ SR a štandardmi, ktoré vychádzajú zo základných princípov  
kontroly v rámci medzinárodných štandardov najvyšších kontrolných inštitúcií (ISSAI). Kontroly vykonali štyria  
kontrolóri s viacročnou kontrolórskou praxou na Úrade. Identifikované riziká – nesprávny spôsob zrušenia  
štátneho podniku a nedostatočná starostlivosť o majetok štátu boli potvrdené.  
Podľa zákona o štátnom podniku – majetok a záväzky pri zlúčení prechádzajú zo zanikajúceho podniku na iný už  
jestvujúci podnik, ktorý sa tým stáva jeho právnym nástupcom. Napriek tomu časť majetku, ktorý mal v správe  
zaniknutý štátny podnik, využívala od 1.1.2023 štátna príspevková organizácia IZPI.  
NKÚ SR sa preto rozhodol preveriť proces reorganizácie štátnej príspevkovej organizácie a proces zlučovania  
štátnych podnikov, preveriť legislatívnu oporu rozhodnutí MPRV SR v súvislosti so zrušením štátneho podniku  
Agroinštitút Nitra a s prechodom správy majetku na príspevkovú organizáciu a získať tým ucelený pohľad na dopad  
rozhodnutí ministerstva na majetok štátu, jeho využívanie a nakladanie s ním.  
Štátny podnik Agroinštitút Nitra nebol zrušený v súlade so zákonom o štátnom podniku. Podľa článku 2 ústavy  
môžu štátne orgány konať iba na základe ústavy, v jej medziach a v rozsahu a spôsobom, ktorý ustanoví zákon.  
Zároveň zákon o organizácii činnosti vlády a organizácii ústrednej štátnej správy ukladá ministerstvám povinnosť  
dbať o náležitú právnu úpravu vecí patriacich do ich pôsobnosti a o dodržiavanie zákonnosti v oblasti svojej  
pôsobnosti. Ministerstvá nie sú oprávnené vypĺňať medzery v právnych predpisoch ich svojvoľným výkladom.  
V zmysle zákona o štátnom podniku môže majetok zanikajúceho štátneho podniku prejsť iba na jeho právneho  
nástupcu. Zákon o štátnom podniku povoľuje odňatie správy majetku štátnemu podniku iba v prípadoch  
a za podmienok ustanovených zákonom alebo ak tak ustanoví medzinárodná zmluva.  
Spôsob zrušenia štátneho podniku Agroinštitút Nitra so sebou priniesol veľkú právnu neistotu a s ňou  
spojené množstvo praktických problémov, s ktorými sa museli vysporiadať viaceré orgány štátnej správy, ako  
aj príspevková organizácia IZPI. MPRV SR si nedalo vypracovať právnu analýzu napriek tomu, že bolo upozornené  
na možnú nezákonnosť navrhovanej reorganizácie a transformácie štátnych organizácií v jeho pôsobnosti.  
Výsledkom bolo, že rozhodnutia, ktoré vydalo, neboli v súlade s príslušnými právnymi predpismi. V dôsledku toho  
MPRV SR na určité obdobie stratilo kontrolu nad časťou majetku štátu, ktorá sa dostala do dočasnej správy  
okresných úradov. Všeobecná hodnota tohto majetku podľa znaleckého posudku bola na úrovni 11,1 mil. eur,  
z toho budovy a pozemky tvorili sumu 10,7 mil. eur. Navyše tento majetok, do času prevzatia jeho správy  
okresnými úradmi, nemal de facto žiadneho správcu. V tomto období držal majetok v domnelej správe IZPI, pričom  
nakladanie s ním mu MF SR nemohlo schváliť, pretože odmietlo uznať oprávnenie tejto príspevkovej organizácie  
ako správcu a právneho nástupcu štátneho podniku. Nehnuteľný a vymedzený hnuteľný majetok bol v čase  
ukončenia kontroly prevedený z dočasnej správy do správy IZPI.  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Čo odporúčame  
NKÚ SR odporúča Výboru Národnej rady SR pre hospodárske záležitosti iniciovať novelu zákona o štátnom  
podniku predovšetkým z dôvodu jeho zosúladenia s aktuálnym právnym stavom, za ktorým zaostáva v dôsledku  
dynamiky vývoja legislatívy.  
2
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
VÝKON KONTROLNEJ AKCIE  
Účel kontrolnej akcie  
Účelom kontrolnej akcie bolo preveriť proces zrušenia štátneho podniku Agroinštitút Nitra a jeho dopad na správu  
majetku štátu. Úrad preveril rozhodnutia MPRV SR, súvisiace so zrušením štátneho podniku a prechodom správy  
majetku, ako aj dopady týchto rozhodnutí na majetok štátu, jeho využívanie a nakladanie s ním.  
Rámec kontrolnej akcie  
Kontrolovaným obdobím boli roky 2022 až 2024 a súvisiace obdobia. Pri kontrole bolo použité detailné preverenie  
dokladov a dokumentov týkajúcich sa predmetu kontroly a rozhovory so zamestnancami kontrolovaných subjektov.  
Výsledky kontrolnej akcie  
Po schválení Strategického plánu Spoločnej poľnohospodárskej politiky na roky 2023 – 2027 sa MPRV SR rozhodlo  
vybudovať kvalitatívne nový funkčný pôdohospodársky znalostný a informačný systém AKIS, a to reorganizáciou  
dvoch štátnych organizácií v jeho pôsobnosti – štátneho podniku Agroinštitút Nitra a príspevkovej organizácie  
Agentúra pre rozvoj vidieka.  
V prvom kroku transformačného plánu mal byť k 31.12.2022 zrušený Agroinštitút Nitra bez likvidácie s určením  
prechodu vytipovaného majetku a činností tohto štátneho podniku na príspevkovú organizáciu Agentúra pre rozvoj  
vidieka. Uvedený krok MPRV SR plánovalo uskutočniť rozhodnutím zakladateľa presunúť znalostnú zložku  
(vedecko-výskumnú náplň) štátneho podniku spolu s knižnicou, informačnými technológiami, doškoľovacím  
centrom v Lučenci, administratívnou budovou a hotelom v Nitre pod príspevkovú organizáciu. Rozhodnutím  
zakladateľa mal ostatný majetok, práva a záväzky prejsť do štátneho podniku agrokomplex NÁRODNÉ  
VÝSTAVISKO.  
V druhom kroku malo prísť k vytvoreniu Národného pôdohospodárskeho kompetenčného centra (NPKC)  
z príspevkovej organizácie Agentúra pre rozvoj vidieka k 1.1.2023. Jeho názov bol neskôr zmenený na IZPI.  
Prijatiu tohto transformačného plánu nepredchádzala právna analýza jeho uskutočniteľnosti ani dopadu.  
Rozhodnutím MPRV SR z augusta 2022 malo 1.1.2023 prísť k začleneniu činnosti štátneho podniku Agroinštitút  
Nitra na uspokojovanie verejnoprospešných záujmov a súvisiacich pracovnoprávnych vzťahov do organizačnej  
štruktúry štátnej príspevkovej organizácie Agentúra pre rozvoj vidieka. MPRV SR zároveň rozhodlo o vyňatí správy  
zodpovedajúcej časti majetku štátu, finančných prostriedkov, práv, povinností a záväzkov zo štátneho podniku  
k 31.12.2022 a o ich vklade do príspevkovej organizácie k 1.1.2023, pričom organizácia mala týmto dňom zmeniť  
svoj názov na Inštitút znalostného pôdohospodárstva a inovácií. MPRV SR bolo v súvislosti s predmetným  
rozhodnutím upozornené zástupcami štátneho podniku Agroinštitút Nitra na jeho zrejmý nesúlad so zákonom  
o štátnom podniku.  
V nadväznosti na toto rozhodnutie MPRV SR rozhodnutím z novembra 2022 zrušilo štátny podnik Agroinštitút Nitra  
bez likvidácie zlúčením so štátnym podnikom agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO k 1.1.2023.  
V rozhodnutí ďalej uložilo štatutárnym orgánom Agentúry pre rozvoj vidieka a štátneho podniku Agroinštitút Nitra  
vyhotoviť súpis o vecnom a finančnom vymedzení majetku, vrátane súvisiacich práv, záväzkov a pohľadávok  
k 31.12.2022 a štatutárnemu orgánu štátneho podniku Agroinštitút Nitra uložilo previesť 31.12.2022 určené  
finančné prostriedky na príslušné účty MPRV SR, ktoré ich následne 1.1.2023 poslalo na príslušné účty IZPI.  
Zároveň uložilo štatutárnym orgánom štátnych podnikov agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO a Agroinštitút  
Nitra vyhotoviť súpis o vecnom a finančnom vymedzení majetku, vrátane súvisiacich práv, záväzkov a pohľadávok  
k 31.12.2022 a štatutárnemu orgánu štátneho podniku Agroinštitút Nitra previesť 31.12.2022 určené finančné  
prostriedky na príslušné účty štátneho podniku agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO.  
Všetky tri dotknuté štátne organizácie postupovali v zmysle rozhodnutí MPRV SR. Štátny podnik Agroinštitút Nitra  
zanikol ku dňu 1.1.2023 výmazom z Obchodného registra.  
3
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Štátny podnik Agroinštitút Nitra a Agentúra pre rozvoj vidieka uzatvorili dňa 30.12.2022 Dohodu o prechode práv  
a povinností, v zmysle ktorej mali na príspevkovú organizáciu prejsť práva a povinnosti štátneho podniku vrátane  
zamestnancov, správy majetku štátu, finančných prostriedkov, pohľadávok a záväzkov a ďalších činností  
zanikajúceho podniku. Agentúra pre rozvoj vidieka zmenila 1.1.2023 svoj názov na Inštitút znalostného  
pôdohospodárstva a inovácií.  
Zanikajúci štátny podnik Agroinštitút Nitra a nástupnícky štátny podnik agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO  
uzatvorili dňa 31.12.2022 Protokol o vymedzení majetkových hodnôt a záväzkov, v zmysle ktorého prešiel  
na nástupnícky podnik iba ekonomický softvér a pohľadávka voči zanikajúcemu podniku v sume 30 tis. eur, ktorú  
Agroinštitút Nitra, štátny podnik, ku koncu roka 2022 uhradil prevodom finančných prostriedkov na účet nástupcu.  
IZPI od januára 2023 využíval na plnenie úloh v rámci predmetu svojej činnosti majetok štátu, ktorý do 31.12.2022  
spravoval zaniknutý štátny podnik a ako správca nehnuteľného majetku štátu bol zapísaný aj na príslušných listoch  
vlastníctva. Štátny podnik vykázal v účtovnej závierke k 31.12.2022 hodnotu budov vo výške necelých 3,9 mil. eur  
a pozemkov vo výške necelých 200 tis. eur. Všeobecná hodnota týchto budov bola podľa znaleckého posudku  
vo výške 9 mil. eur a pozemkov takmer 1,7 mil. eur. Rozdiely vzniknuté medzi reálnou a účtovnou hodnotou tohto  
majetku neboli v zrušenom štátnom podniku zaúčtované.  
Agroinštitút Nitra, štátny podnik, mal k 31.12.2022 uzatvorené nájomné zmluvy na užívanie nebytových priestorov  
v nehnuteľnostiach v Nitre s 32 a v Lučenci s 26 nájomcami. Napriek tomu, že IZPI nebol jeho právnym nástupcom,  
nevyužité nebytové priestory prenajímal v zmysle usmernenia MPRV SR na základe pôvodných nájomných zmlúv  
uzatvorených štátnym podnikom. V predmetnom usmernení bol osobitný zreteľ kladený na nájomné zmluvy  
so štátnymi organizáciami, s ktorými mal IZPI uzatvoriť zmluvy o výpožičke. Na ich platnosť bol však potrebný  
súhlas MF SR. Toto usmernenie bolo vypracované v súlade s oporným stanoviskom MF SR z novembra 2022,  
ktoré v tom čase neskúmalo zákonnosť prechodu majetku štátu pod správu IZPI. Príjmy z prenájmu nebytových  
priestorov dosiahli v roku 2023 sumu 684 tis. eur. IZPI v plnej výške uhradil záväzky zaniknutého štátneho podniku.  
Prvé možné komplikácie, týkajúce sa prechodu majetku štátu zo štátneho podniku Agroinštitút Nitra na IZPI, sa  
objavili v súvislosti so zaevidovaním tohto majetku do centrálneho ekonomického systému, do ktorého bola  
príspevková organizácia od 1.1.2023 zapojená. MPRV SR, ako zriaďovateľ IZPI, bolo presvedčené, že majetok má  
prejsť do evidencie príspevkovej organizácie v účtovných hodnotách, naproti tomu zástupcovia MF SR zastávali  
názor, že musí byť ocenený reálnou hodnotou. Na účel stanovenia všeobecnej hodnoty majetku po zrušenom  
štátnom podniku dal IZPI vypracovať znalecký posudok, na ktorý vynaložil takmer 40 tis. eur bez DPH. V súvislosti  
s prechodom správy majetku štátu príspevková organizácia vynaložila ďalších takmer 10 tis. eur bez DPH  
za právne služby poskytnuté v období január až marec 2023.  
Minister pôdohospodárstva a rozvoja vidieka SR v marci 2023 požiadal ministra financií SR o usmernenie, ako  
správne postupovať pri evidencii majetku v správe IZPI. Na jeho list reagoval minister financií SR až v júni 2023,  
kedy v súvislosti s procesom reorganizácie dvoch štátnych organizácií oslovil ministra hospodárstva SR.  
Na základe stanoviska ministra hospodárstva SR, minister financií SR v auguste 2023 odpovedal, že, podľa jeho  
názoru, MPRV SR ani IZPI nemôžu byť právnymi nástupcami štátneho podniku Agroinštitút Nitra, rozhodnutie  
MPRV SR z 21.11.2022 označil za zmätočné a uviedol, že nemohlo dôjsť ani k zákonnému prechodu majetku štátu  
v správe zrušeného štátneho podniku na MPRV SR a neskôr na IZPI. Minister vyjadril presvedčenie, že majetok  
štátu v správe zrušeného štátneho podniku neprešiel do správy nástupníckeho štátneho podniku agrokomplex  
NÁRODNÉ VÝSTAVISKO, MPRV SR a ani do správy IZPI a skonštatoval, že majetok štátu, ktorý nie je v správe  
žiadneho správcu, spravuje podľa zákona o správe majetku štátu dočasný správca, tzn. okresný úrad v sídle kraja,  
v ktorého územnom obvode sa majetok nachádza.  
MPRV SR v decembri 2023 predložilo okresným úradom v Nitre a v Banskej Bystrici list ministra financií SR  
na ďalšie konanie. Týmto momentom MPVR SR stratilo kontrolu nad majetkom po zaniknutom štátnom podniku,  
ktorého bolo zakladateľom.  
Zapojenie IZPI do centrálneho ekonomického systému bez zohľadnenia špecifík v súvislosti s plánovaným  
prevzatím agendy štátneho podniku Agroinštitút Nitra a technickou nemožnosťou preklopenia jeho dát sa negatívne  
4
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
prejavilo nezostavením účtovnej závierky príspevkovej organizácie k 31.12.2023 v zákonom stanovenom termíne,  
ale až v júni 2024. NKÚ SR zároveň zistil, že štátna príspevková organizácia nevykonala k 31.12.2023  
inventarizáciu, ktorou sa overuje, či stav majetku, záväzkov a rozdielu majetku a záväzkov v účtovníctve zodpovedá  
skutočnosti. V oboch prípadoch došlo k porušeniu zákona o účtovníctve.  
Okresný úrad Nitra sa ujal dočasnej správy majetku po zaniknutom štátnom podniku vo februári 2024, kedy prišlo  
aj k zápisu zmeny správcu z IZPI na okresný úrad na liste vlastníctva k nehnuteľnostiam v Nitre.  
Okresný úrad riešil dočasnú správu majetku takého rozsahu a štruktúry prvýkrát. Na účely stanovenia postupu  
prevodu správy, ako aj usmernenia k vedeniu účtovnej evidencie tohto majetku sa v marci 2024 uskutočnilo  
pracovné stretnutie na MF SR za účasti MPRV SR, MV SR a oboch dotknutých okresných úradov. MF SR navrhlo  
spôsob prevodu správy majetku štátu na štátnu príspevkovú organizáciu IZPI, ktorá ho nevyhnutne potrebovala  
na plnenie úloh v rámci predmetu svojej činnosti.  
V prvom kroku bolo nutné identifikovať nehnuteľný a vymedzený hnuteľný majetok, ktorý mal byť predmetom  
ponukového konania na prevod správy v zmysle zákona o správe majetku štátu. Následne bolo potrebné  
bez zbytočného odkladu ponúknuť tento nehnuteľný a vymedzený hnuteľný majetok štátu v ponukovom konaní  
ostatným správcom. MF SR zároveň upozornilo na nutnosť bezodkladne začať s uzatváraním dohôd o urovnaní  
v prípade úspešného prevodu správy majetku štátu na štátnu príspevkovú organizáciu IZPI.  
Okresný úrad Nitra zverejnil ponuky na prevod správy nehnuteľného a vymedzeného hnuteľného majetku v máji  
2024. Od záujemcov, ktorými boli štátne rozpočtové a príspevkové organizácie alebo štátne fondy nebola za prevod  
správy majetku požadovaná odplata. Od ostatných správcov bola požadovaná odplata v minimálnej výške  
všeobecnej hodnoty majetku podľa znaleckého posudku, a to v prípade nehnuteľností v Nitre vo výške  
9 580 tis. eur a v prípade vymedzeného hnuteľného majetku vo výške 41 tis. eur. Jediným záujemcom o prevod  
správy majetku štátu po zaniknutom štátnom podniku bol IZPI.  
V centrálnom registri zmlúv boli zverejnené zmluvy o prevode správy nehnuteľného a hnuteľného majetku štátu  
medzi IZPI a Okresnými úradmi Nitra a Banská Bystrica, ktoré nadobudli účinnosť v júni 2024. V čase ukončenia  
výkonu kontroly však naďalej nebolo doriešené preklopenie dát z účtovného programu IZPI do účtovného programu  
MV SR a späť v súvislosti s účtovaním o majetku v dočasnej správe a rovnako nebola vyriešená otázka  
financovania výdavkov na túto migráciu.  
Záver  
NKÚ SR kontrolou procesu zrušenia štátneho podniku Agroinštitút Nitra preukázal, že rozhodnutia MPRV SR  
nevychádzali z platnej legislatívnej úpravy SR.  
Rozhodnutie o vyňatí správy časti majetku zo štátneho podniku nebolo v súlade so zákonom o štátnom podniku,  
keďže NKÚ SR neidentifikoval žiadne zákonné zmocnenie alebo oprávnenie z medzinárodnej zmluvy a MPRV SR  
svoju legitimáciu pri vydaní rozhodnutia nepodložilo konkrétnym ustanovením právneho predpisu alebo  
medzinárodnej zmluvy, a teda nepreukázalo, že splnilo podmienky pre vydanie predmetného rozhodnutia.  
MPRV SR rovnako nemalo oprávnenie na vydanie rozhodnutia k prechodu správy majetku štátu medzi štátnym  
podnikom a štátnou príspevkovou organizáciou. V zmysle platnej legislatívy možno uvažovať o prechode správy  
majetku štátu medzi štátnymi organizáciami iba v prípade, ak by tak ustanovil osobitný predpis alebo na základe  
právneho nástupníctva po zaniknutom správcovi majetku štátu. Štátna príspevková organizácia nemohla byť  
právnym nástupcom štátneho podniku, tým môže byť iba iný štátny podnik.  
MPRV SR napriek upozorneniu na chýbajúci právny rámec navrhovaného postupu transformácie v začatom  
procese pokračovalo a ďalším rozhodnutím zrušilo štátny podnik Agroinštitút Nitra bez likvidácie zlúčením  
so štátnym podnikom agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO k 1.1.2023. Toto rozhodnutie spôsobilo, že časť  
majetku štátu nemala žiadneho správcu, a to až do času prevzatia dočasnej správy okresnými úradmi.  
Rozhodnutia MPRV SR boli nevykonateľné z hľadiska obsahu práv a povinností a súčasne vytvorili neudržateľný  
stav z hľadiska právnej neistoty, tak pre správcov majetku štátu, jeho dočasných správcov, ako aj tretích osôb, čo  
5
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
bolo v rozpore s princípom legality podľa článku 2 odsek 2 ústavy, ktorý sa kladie na kvalitu každého vydaného  
rozhodnutia orgánov verejnej správy.  
Reakcia kontrolovaného subjektu  
Kontrolované subjekty nevzniesli námietky proti pravdivosti, úplnosti a preukázateľnosti kontrolných zistení.  
Kontakt  
Najvyšší kontrolný úrad SR  
Priemyselná 2  
Ministerstvo pôdohospodárstva a rozvoja vidieka SR  
Dobrovičova 12  
824 73 Bratislava 26  
812 66 Bratislava – Staré Mesto  
Inštitút znalostného pôdohospodárstva a inovácií agrokomplex NÁRODNÉ VÝSTAVISKO, štátny podnik  
Akademická 952/4  
949 01 Nitra  
Výstavná 4  
949 01 Nitra  
Ministerstvo vnútra Slovenskej republiky – Okresný úrad Nitra  
Štefánikova trieda 69  
949 01 Nitra  
+421 37 6549 111  
Zoznam použitých skratiek  
IZPI  
Inštitút znalostného pôdohospodárstva a inovácií  
príspevková organizácia  
MF SR  
MH SR  
MPRV SR  
Ministerstvo financií Slovenskej republiky  
Ministerstvo hospodárstva Slovenskej republiky  
Ministerstvo pôdohospodárstva a rozvoja vidieka  
Slovenskej republiky  
MV SR  
NKÚ SR, Úrad  
SR  
Ministerstvo vnútra Slovenskej republiky  
Najvyšší kontrolný úrad Slovenskej republiky  
Slovenská republika  
Ústavný zákon č. 460/1992 Zb. Ústava Slovenskej  
republiky v znení neskorších predpisov  
Zákon č. 575/2001 Z. z. o organizácii činnosti vlády a  
organizácii ústrednej štátnej správy v znení neskorších  
predpisov  
ústava  
zákon o organizácii činnosti vlády a organizácii ústrednej  
štátnej správy  
Zákon č. 278/1993 Z. z. o správe majetku štátu v znení  
neskorších predpisov  
Zákon č. 111/1990 Zb. o štátnom podniku v znení  
neskorších predpisov  
Zákon č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení neskorších  
predpisov  
zákon o správe majetku štátu  
zákon o štátnom podniku  
zákon o účtovníctve  
6