Cieľmi návrhu zákona je najmä zmena zloženia akademickej obce akadémie v nadväznosti na navrhovanú zmenu voličskej základne verejnej výskumnej inštitúcie, zmena pôsobností snemu, vedeckej rady a predsedníctva akadémie, zmena zloženia vedeckej rady akadémie, vytvorenie a úprava pôsobnosti Komisie pre posudzovanie vedeckej kvalifikácie výskumných pracovníkov, transformácia organizácií akadémie na verejné výskumné inštitúcie.