Medzi hlavné zmeny, ktorými sa návrh zákona odlišuje od existujúcej právnej úpravy patrí
-formálne oddelenie schémy obchodovania (skleníkové plyny) od systému obchodovania (znečisťujúce látky);
-spôsob, akým sa stanovia celkové konečné ročné množstvá bezodplatne pridelených kvót na každý rok počas obchodovateľného obdobia;
-zohľadnenie zmien charakteru, činnosti a každej významnej zmeny kapacity prevádzky, ktorá môže byť dôvodom na zmenu povolenia alebo na vyradenie zo schémy obchodovania alebo zo systému obchodovania;
-úprava množstva bezodplatne pridelených kvót v prípade významnej zmeny kapacity prevádzky, zníženia úrovne činnosti prevádzky, zníženia a nasledujúceho zvýšenia úrovne činnosti prevádzky a ukončenia činnosti prevádzky;
-pravidlá pre pridelenie bezodplatných kvót novým účastníkom schémy obchodovania;
-použitie jednotiek certifikovaného zníženia emisií (CER) a jednotiek zníženia emisií (ERU) z projektových aktivít v schéme obchodovania;
-spôsob zisťovania a vykazovania údajov o tonokilometroch a zisťovania a vykazovania údajov e emisiách skleníkových plynov v súlade s monitorovacími plánmi prevádzkovateľa lietadla;
-právna úprava pre vnútroštátneho správcu emisných kvót;
-dražba emisných kvót a použitie príjmov z dražby emisných kvót;
-akreditácia oprávnených overovateľov;
-právna úprava pre prípad porušenia na trhu dražených produktov;
-dohľad Národnej banky Slovenka;
-úprava kategórií činností uvedených v prílohách zákona.
Ďalším z hlavných dôvodov návrhu zákona je zosúladenie právneho stavu s potrebami praxe.
Účelom návrhu zákona je zabezpečiť efektívne fungovanie schémy obchodovania v podmienkach Slovenskej republiky tak, aby z pohľadu životného prostredia boli v schéme obchodovania začlenení prevádzkovatelia, ktorí majú významný vplyv na celkové emisie skleníkových plynov v Slovenskej republike.
Návrh predkladaného zákona je v súlade s Dohovorom Európskej hospodárskej komisie Organizácie Spojených národov z 25. júna 1998 o prístupe k informáciám, účasti verejnosti na rozhodovacom procese a prístupe k spravodlivosti v záležitostiach životného prostredia (tzv. Aarhuský dohovor).